人類登革感染中匯聚的抗體指紋

Poornima Parameswaran, Yi Liu, Krishna M. Roskin, Katherine K.L. Jackson, Vaishali P. Dixit,  Ji-Yeun Lee, Karen L. Artiles, Simona Zompi, Maria Jose´ Vargas, Birgitte B. Simen, Bozena Hanczaruk, Kim R. McGowan, Muhammad A. Tariq, Nader Pourmand, Daphne Koller, Angel Balmaseda, Scott D. Boyd, Eva Harris, and Andrew Z. Fire. Cell Host & Microbe. 13, 691-700 (2013)

Speaker: Po-Jung Fu (傅柏蓉)                                     Time: 13:00~14:00, Nov. 20, 2013.

Commentator: Dr. Trai-Ming Yeh (葉才明 老師)       Place: Room 601

Abstract:

    登革病毒屬於黃熱病毒科，是一由蚊子傳播的單股RNA病毒，每年引起約30億人感染。登革病毒可分成四種血清型，所引起的臨床感染可從無症狀的感染到致命的登革出血熱及登革休克熱。目前對於登革病毒感染仍未有疫苗或是抗病毒的治療方法，也缺乏診斷的生物指標，因此造成了健康照護體系很大的負擔。[1]. 以高通量定序法檢測抗體基因加速了對人類免疫球蛋白重鏈指紋的了解。[2]. 為了知曉六十個受登革病毒感染的病人的抗體指紋，作者們利用了條碼是多對引子以PCR方式放大抗體重鏈的高度變異區，接著再進行次世代定序。互補性決定區3 (Complementarity-determining region 3, CDR3) 在抗體重鏈基因中主要決定抗體專一性，這區的基因在不同的正常個體中呈現不同的指紋。在CDR3中的每一個胺基酸，其物理化學型錄(分子量、等電點、親水性)都非常相似。物理化學特性在抗原辨認中扮演很重要的腳色。有趣的是，作者發現在受登革染的病人中，其CDR3指紋有匯聚的現象，顯示出當宿主遭受病原菌感染(例如登革病毒)時，重鏈CDR3區的基因會經由修飾(如B細胞親和性成熟)過程而匯聚。總的而言，這篇文獻提供了一個引人注目的例證指出在人類感染症中，可以發現相似的抗體指紋。此外，這些在登革病毒感染病人中發現的匯聚的抗體指紋可以作為有潛力的診斷指標或是在登革病毒盛行的社區追蹤監控登革病毒暴露情況。

References:

1. Bhatt S., Gething P.W., Brady O.J., Messina J.P., Farlow A.W., Moyes C.L., Drake J.M., Brownstein J.S., Hoen A.G., Sankoh O., Myers M.F., George D.B.,Jaenisch T., Wint G.R., Simmons C.P., Scott T.W., Farrar J.J., Hay S.I. (2013). The global distribution and burden of dengue. Nature 496, 504-507.

2. Boyd S.D., Marshall E.L., Merker J.D., Maniar J.M., Zhang L.N., Sahaf B., Jones C.D., Simen B.B., Hanczaruk B., Nguyen K.D., Nadeau K.C., Egholm M.,Miklos D.B., Zehnder J.L., Fire A.Z.(2009). Measurement and clinical monitoring of human lymphocyte clonality by massively parallel VDJ pyrosequencing. Sci. Transl. Med. 1, 12ra23.