黃熱病毒科病毒RNA的N6-Methyladenosine可調控病毒的感染力

論文：N6-Methyladenosine in Flaviviridae Viral RNA Genomes Regulates Infection

Cell host & microbe 20, 654–665 November 9, 2016

報告者: Po-Chun Chang (張博淳)           時間: 14:00~15:00 Mar. 29, 2017

講評老師: Dr. Yao Chang (張堯 老師)                地點: Room 601

摘要：

N6-methyladenosine (m⁶A)為一種RNA的化學性修飾，並參與在許多生物反應中．Methyltransferase-like (METTL) enzyme像是METTL3或METTL4會在DRA^mCH motif (D = G/A/U, R = G > A, H = U/C/A)進行m⁶A的修飾．而demethylases像是fat mass and obesity-associated protein (FTO)會移除此修飾，此外，m⁶A的鍵結蛋白像是YTH-domain family (YTHDF)能使m⁶A達到其功能．他們三者各自像是writer, eraser和reader作用著．雖然m⁶A已經被知道會參與在許多真核細胞的反應中，但對於微生物感染的相關研究則仍然有限．先前的文獻中指出部分在細胞核內進行複製的病毒其轉錄後的RNA內會具有m⁶A的修飾，像是A型流感病毒和腺病毒．本篇文獻的作者團隊在先前的研究中發現m⁶A對於HIV-1具有正調控的角色．¹然而那些對於只在細胞質內進行複製的病毒而言，m⁶A是否也具有其角色是個令人好奇的問題．因此，本篇文獻中，作者試著利用HCV此一黃熱病毒科的病毒去探討這個問題．首先，作者分別利用METTL，FTO以及YTHDF silenced的Huh7細胞去證實m⁶A的機制會調控HCV病毒顆粒的產生卻不影響其轉譯或是RNA的複製．接著他們發現在HCV感染時，YTHDF蛋白會去和HCV的RNA鍵結，並移動到脂質小滴．此外，他們也證實雖然HCV的複製過程並不會進入細胞核中，但在感染時其RNA仍然會具有m⁶A的修飾．接著他們利用Methyl-RIP接續著定序的方式而成功找出HCV RNA上具有m⁶A的位置．將此結果和病毒基因上YTHDF的鍵結位置進行比對後，他們發現在病毒E1基因內的一個片段同時具有m⁶A的修飾並且能藉由DRAmCH motifs而被YTHDF蛋白所鍵結．此外，作者也試著找出其他黃熱病毒科病毒RNA上具有m⁶A的位置，有趣的是這些位置似乎具有一定的共通性．藉由這樣的研究結果不只找到了黃熱病毒科此一只在細胞質內進行複製的病毒的RNA上m⁶A的位置，也提供了一個可能的抗病毒複製的方向．

參考資料：

1          Kennedy, E. M. et al. Posttranscriptional m(6)A Editing of HIV-1 mRNAs Enhances Viral Gene Expression. Cell host & microbe 19, 675-685, 2016.04.002 (2016).