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微生物科包含四個學門：細菌學、病毒學、寄生蟲學及免疫學，它連繫著基礎醫學與臨床醫學，因此微生物科開授大學部的醫學微生物學，其教學目標在使學生瞭解這三方面的基本概念與其應用，以提供日後不論從事研究或臨床服務的基礎。而研究所的設立是配合本校醫學中心發展的需要，培育細菌、病毒及免疫方面的人才，並加強醫學院在微生物學及免疫學方面的教學，因此研究所的教學目標在培養微生物、病毒及免疫學的專業科技人才。
醫學院其他研究所開設的課程如：微生物基因體學(2學分)、蛋白體學之原理與應用(2學分)、感染症轉譯生醫影像應用(1學分)、分子遺傳學(1學分)、分子技術學(2學分)、個人化醫學檢驗(1學分)、生物晶片之癌症檢測(2學分)、疾病之分子與病理機轉(1學分)、轉譯醫學成果與應用(1學分)、生物巨分子與物理解析(2學分)、幹細胞分析實驗(1學分)、幹細胞及再生醫學綜論(1學分)，皆可選修。
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碩士班畢業學分規定 24 學分(必修學分至少17學分；論文學分另計)，包括下列項目：
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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實驗微生物及免疫學
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蕭璦莉
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碩一下
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1
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針對分子生物、細菌、病毒及免疫學等方面，由具不同領域專長之老師講授其所專精之基本實驗技術，並提供學生親手操作成功的實做經驗。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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研究倫理
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彭貴春
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碩一上
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1
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「研究倫理」為研究所課程，主要藉由課堂教學與分組討論構成。本課程由堂課所組成，授課時間為一學期。研究倫理對於進行研究相關領域的碩士班學生是必備的條件，本課程便是訓練研究所學生具備研究倫理的概念。隨著課程的進展，期許碩士班學生能從課堂討論的參與度和發問中完全理解課程的內容，讓學生在執行研究和撰寫論文上具備解決及釐清攸關研究論理問題的能力。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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免疫學
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凌 斌
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碩一上
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3
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本課程講授免疫學的基本概念，注重免疫細胞、細胞激素的交互作用及調節，並涵蓋各種免疫疾病。上課方式採部分授課和部份討論方式進行，強調溝通與集體討論，學生也須針對特定主題作文獻報告。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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分子生物學
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凌 斌
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碩一上
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3
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本課程講授分子生物學的基本概念，以分子層次探討生命科學的奧妙，並涵蓋後基因體時代所使用之重要技術與理論、方法與實例。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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醫學微生物學
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蕭璦莉
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碩一下
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3
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本課程提供微免所學生學習醫學有關的微生物，包括細菌學、真菌學及病毒學，也利用實際病例的問題導向學習，增加教學內容與效率，鼓勵學生透過討論來學習。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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高等病毒學
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劉校生
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碩一下
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3
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本課程以分子生物學之觀點，將 DNA 及 RNA 病毒之複製與繁殖之機轉分門別類，並選擇具代表之病毒做深入淺出之介紹。學生於期末得選具臨床重要性之病毒，報導最新之研究現況。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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高等細菌學
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何漣漪
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碩一下
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3
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本課程藉碩一上所建立之微生物學及分子生物學基礎，更進一步地探討有關細菌各種重要生理機能及遺傳方面研究的最新發展。除講義授課之外，並討論所指定或學生自選之相關重要文獻。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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英文論文閱讀與寫作
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王淑鶯
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碩二上
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2
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本課程教導英文寫作的基本概念、技巧，以口授、練習寫作並由授課老師批改等方式交替進行，藉此培養日後發表論文之寫作能力。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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專題討論 (seminar)
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凌 斌；黃一修
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每學期
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4
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本課程的主要目的在使研究生能得到廣泛與紮實的專題討論訓練。每學期的專題討論由所長指定二位老師負責，依摘要撰寫、口頭報告的表達能力、組織及綜合批判能力、時間控制及問題回答，由參加聽講的老師評分，並請一位講評老師於報告後講評。為使學生有較廣泛的接觸，其所涉獵題目在研究所一年級以與指導教授不同專長或所研究題目不同為原則，由負責老師與學生討論決定。待二年級以後，才歸該研究生指導教授負責。此外也鼓勵研究生參加他所或院內舉辦之演講或 immunology、molecular biology、infectious disease 等 journal club 討論會。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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免疫學特論
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張志鵬
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碩二上
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3
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本課程針對免疫學重要的研究主題， 以文獻討論的方式，做深入的探討。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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動物實驗研究
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余俊強
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碩一二下
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2
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本課程為學生介紹與動物實驗相關的研究方法，課程的設計是站在研究人員的立場，著重實用性，並非純粹的統計學。課程內容包括實驗設計原理、文獻的搜集、整理、閱讀和分析、口頭報告技巧、數據統計分析(包括軟體的應用)、圖表製作、科學論文寫作和動物實驗相關的實驗技術等。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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生物科學的理則
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楊倍昌
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碩一上
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2
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了解生物科學研究基本的思考方式；養成批判的精神，建立多元思辯的能力；建構生物科學知識在的哲學，社會學裡的意義。授課方式：本課程設計分成四個部份；講解、指定討論、座談、隨堂作業並用。泛論生物學研究的幾項實戰經驗，建立生物學實驗基本的研究邏輯，將由各個不同的立場來討論生物科學知識和生物科技的進展，利用演化論當作例子，回顧生物科學假說的建立型式。思辯的能力也許無法精確量化，但是它可以部份表現在討論的參與程度，這堂課不是通識教育課；碩士博士生就應該有碩士博士生的精神，本課程沒有筆試，成績由學生自己合理評分，基本分數85 分，自評合理時(高估或是低估都要扣分)依學生要求給分，平時上課討論踴躍加十分，時有佳論加五分，平時作業佔十五分(精采：10-15；太差：0-5)，缺席每節扣五分，若有上述無法涵蓋者請相信老師的直覺。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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感染症學
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林以行
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碩二上
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3
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感染症學是主題式的課程，以成大醫學院微免所或相關的研究人員專精的主題，包括HBV、HSV、HCV、HIV、流行性感冒病毒、登革病毒、腸病毒71、幽門桿菌、A型鏈球菌、及肺結核桿菌，講述他們在感染和免疫系統間的關係。每次課有一個主題，先由老師做概況性的介紹，再由參與的師生以討論為主。其目的在以主題式的教學，引起師生的興趣，結合基礎與臨床，促進成大醫學中心傳染性疾病的學術研究。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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基因治療特論
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蕭璦莉
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碩一下
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2
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這是碩士班及博士班兩學分的課程，由數位基礎及臨床老師共同參與教學，此課程主要提供學生整合基礎及臨床基因治療的概念、方法及應用。課程包括基因治療概觀；基因治療之病毒載體；基因治療之非病毒載體；免疫基因治療及DNA疫苗；免疫及細胞基因治療；利用自殺基因、腫瘤裂解性病毒及幹細胞於癌症治療；致癌基因、抑癌基因、細胞週期和基因治療；基因治療於心血管疾病及遺傳性疾病之應用。此外再選用出於英國廣播公司 (BBC) ” Superhuman” 系列的影片來加深學生們的印象，其中“The enemy within”對於腫瘤如何在身體中成長及轉移有深刻的介紹，並敘述數位癌症病人接受基因治療之經過；另外“Killers into cures”則詳細地敘述人類和微生物之間密不可分的關係，甚至可以利用微生物來治療人類的疾病，例如過敏及癌症。課程最後則由學生選擇和基因治療相關的文章，於課堂中口頭報告。評分標準由學生的學習態度（20%）包括出席率及討論時參與度，口頭報告（40%）和期末報告（40%）作為依據。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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腫瘤免疫學
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凌斌、楊倍昌
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碩一下
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2
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此課程著重於探討腫瘤發生與免疫系統間的互動,主要包括下列主題：
(1) 免疫系統對腫瘤細胞的免疫監控(immune surveillance)。
(2) 腫瘤細胞發展免疫脫逃 (immune evasion)的機制。
(3) 如何調控免疫系統以提高對腫瘤細胞的毒殺功能。
(4) 現今免疫療法 (Immunotherapy)及癌症疫苗 (Cancer Vaccines)的發展及應用。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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生物科學史與科學哲學
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楊倍昌
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碩一二下
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2
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課程不是要訓練歷史學家。歷史學有自己的專業。這門課希望培養理解與欣賞歷史學的能力。可能有許多不同的立場來陳述科學史。由文獻史學，社會學，哲學的方式或是由生物學知識的內容本身來看待生物科學的發展。目前在台灣的大學中生物相關科系裡，還很少由自己來探討生物科學史的努力。在醫學院裡也未正式設立醫學史的研究部門。所有的生物科學研究都好像是前無古人一樣，令人不解。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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寄生蟲學
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辛致煒
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碩一二上
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2
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本課程不同於醫用寄生蟲學以蟲種為教學主線，而是著重以研究方向上有系統的介紹基礎寄生蟲學與應用寄生蟲學各方面的知識與技術。教材的主幹內容包括寄生蟲學的基本原哩，最新發展概況，有待解決的前瞻性問題與思路。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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分子生物學資料專論
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辛致煒
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碩一二上
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2
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何謂生物資訊？廣義的解釋，就是在網路上能進行相關於生命科學的各式資訊擷取，進而進行分析與整哩，並能提出預測與推論的學問。如何在多樣雜亂的資訊裡，輕鬆攫取我們有興趣的生物資料，是我們這堂課的目的之一。由於分子生物學的興起，人們以分子的角度探討生物訊息與生物分子間的關係，於是科學家們建構了多了許多分子生物學相關的資料庫，例如基因資料庫、蛋白質資料庫等。由於計算機科技的進步，使得生物資料庫的資料量暴增；同時電腦的計算能力、硬碟容量也有巨大的進步。許多研究的題目（例如：資料庫的建立與整合、序列的比對與分析、基因全序列的定序與基因組地圖建構、蛋白質結構和功能的分析與預測、分子模型的建立與新藥的設計、演化樹的建立等等），吸引了很多科學家投入研究的行列，因而資料庫的資料量愈來愈多，因此如何快速取得有用的資料？如何善用資料？整合資料創造出新的知識，將成為本課程的另一重點。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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生醫領域之職業發展
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黃一修
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碩二上
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2
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為了幫助生命科學相關領域的畢業生，能夠成功地在競爭激烈的就業市場得到一份合適的工作，學生必須在還未踏出學校前就先做好就業準備。本課程的目的是讓學生了解在完成碩士學位之後，有哪些就業機會可以選擇，並藉由履歷練習寫作及英語口說、聽力練習，增加自己的職場競爭力。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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轉譯醫學導論
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彭貴春
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碩一二下
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2
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科學的進步是經由多個研究領域中具有不同專長但相關的專家共同努力工作所促進的，為了加速將研究室應用到臨床醫療中，因而產生了”轉譯醫學”這個概念，明顯的改善由研究室桌邊經驗轉變為病床邊方法的實踐。越來越多的生醫研究的轉譯醫學做出卓越的貢獻，促使我們開設這一門介紹”轉譯醫學”的課程。課程將提供學生深入地瞭解轉譯醫學的原理與實際影響，並鑑知其在生物醫學研究、藥物發展與政策制定中與日俱增的重要性。此外，本課程會提供對有志於以生物醫學研究促進人類健康為未來志向的學生提供一個基礎的認識。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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系統寄生蟲學
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辛致煒
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碩一二下
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2
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系統生物是一項以生物分子為基礎探索複雜的生物組織與機制在系統層次行為的新興跨領域學門。他的特徵是用尖端物理/化學原理設計的高通量測量儀器（如基因晶片、雷射測序儀、質譜儀等）取得系統性的生物數據，經過高速及高容量電腦與先進資料庫技術及演算法整理之後，依此根據物理及統計原理衍生對生物系統的假設（或推論），再由該假設推動系統模型的建立與分析。經過模型行為與生物數據之對比，再對模型做適當之修正，或產生新的數據需求。如此反覆回饋，即可望能向以生物分子為基礎對生物系統的宏觀行為取得瞭解漸進。最終期望應用於寄生蟲學相關研究上。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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過敏免疫學
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王志堯
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碩一二下
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2
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過敏免疫學是研究過敏疾病和變態過敏反應的科學學問。過敏是全球最常見的慢性疾病。過敏症狀過敏的範圍，從生活中的影響日常生活狀況，到可能威脅生命的過敏休克反應。有現代社會中越來越多的人患有過敏性障礙，是根據我們的免疫系統的紊亂，如高過敏反應，炎症反應和全身性過敏反應的疾病。因為過敏（變態反應）研究室綜合臨床免疫學，環境過敏原和感染，因此它是需要有獨特的學習區塊，為研究生學習並可應用這方面的知識在他們的日常研究的實驗及臨床相關研究。
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課程名稱
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開課教師
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開課學期
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學分數
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分子寄生蟲學
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胥直利
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碩一二下
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3
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科技的開展，發現許多寄生蟲的分子生物機制呈現和高等生物不同的獨特性，對寄生蟲學組的研究生而言，分子寄生蟲學是本學門的基礎課程，不僅幫助複習熟知的哺乳動物(宿主)分子生物學，更強調在寄生蟲上發現的不同機制，例如 RNA trans-splicing, mitochondrial RNA editing，polycistronic primary transcript 如何變成mono-cistronic mRNA進入核糖體，為何許多寄生蟲 mRNA synthesis 是 amanitin resistance, micro-RNA study in parasites, VSG基因如何變異躲避宿主抗體追殺，trypanothione和glutathione兩者如何不同等等。比較宿主和寄生蟲間機制運用的不同，認識熟悉其間兩者的異同，除了具有專業知識承先啟後的傳承責任外，也能幫助學生在生物資訊及基因體研究的學門，提供不同演化位階的參考點，更期盼能擴展效應，從異同中找出較佳的藥物作用點，幫助治療疾病。
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